九三學(xué)社主要由科學(xué)技術(shù)以及相關(guān)的高等教育、醫(yī)藥衛(wèi)生領(lǐng)域高、中級(jí)知識(shí)分子組成。

抗戰(zhàn)后期，一批文化教育、自然科學(xué)學(xué)者發(fā)起民主科學(xué)座談會(huì)，后為紀(jì)念1945年9月3日抗日戰(zhàn)爭(zhēng)和世界反法西斯戰(zhàn)爭(zhēng)偉大勝利，更名為九三座談會(huì)，1946年5月4日，改稱九三學(xué)社。

新民主主義革命時(shí)期，九三學(xué)社同中國共產(chǎn)黨團(tuán)結(jié)合作、共同奮斗，為建立中華人民共和國作出了積極貢獻(xiàn)。

社會(huì)主義革命和建設(shè)時(shí)期，九三學(xué)社在中國共產(chǎn)黨領(lǐng)導(dǎo)下，走上為社會(huì)主義服務(wù)道路，為鞏固新生人民政權(quán)、恢復(fù)和發(fā)展國民經(jīng)濟(jì)、推進(jìn)社會(huì)主義建設(shè)，在國家科學(xué)技術(shù)、高等教育和醫(yī)藥衛(wèi)生等領(lǐng)域作出了重要貢獻(xiàn)。

改革開放和社會(huì)主義現(xiàn)代化建設(shè)新時(shí)期，九三學(xué)社積極圍繞經(jīng)濟(jì)建設(shè)中心任務(wù)，自覺服務(wù)改革發(fā)展穩(wěn)定大局，認(rèn)真履行職能，切實(shí)加強(qiáng)自身建設(shè)，先后就教育體制改革、知識(shí)分子政策落實(shí)、三峽工程建設(shè)、延安革命紀(jì)念地保護(hù)和建設(shè)、非典防治、三江源保護(hù)等方面積極建言獻(xiàn)策。

中共十八大以來，中國特色社會(huì)主義進(jìn)入新時(shí)代。在以習(xí)近平同志為核心的中共中央領(lǐng)導(dǎo)下，九三學(xué)社聚焦科研管理體制改革、國家科技創(chuàng)新體系和科技創(chuàng)新平臺(tái)建設(shè)、長(zhǎng)江黃河流域和草原生態(tài)文明建設(shè)等重大事項(xiàng)深入調(diào)研、高質(zhì)量建言；扎實(shí)開展脫貧攻堅(jiān)民主監(jiān)督和長(zhǎng)江生態(tài)環(huán)境保護(hù)民主監(jiān)督工作，積極助力精準(zhǔn)脫貧、全面建成小康社會(huì)和鄉(xiāng)村振興戰(zhàn)略實(shí)施，全力參與新冠肺炎疫情防控阻擊戰(zhàn)，全面加強(qiáng)中國特色社會(huì)主義參政黨建設(shè)，為推進(jìn)新時(shí)代中國特色社會(huì)主義作出了新的貢獻(xiàn)。

九三學(xué)社中央歷任主席為許德珩、周培源、吳階平、韓啟德，現(xiàn)任主席武維華。

截至2022年6月底，九三學(xué)社在30個(gè)省、自治區(qū)、直轄市建立了組織，有社員20.4萬余人。